神话时代
数年前神树曾经结出果实，含有神树中寄宿的查克拉。神树被认为是十尾的真正形态。
1000年前，大筒木辉夜降临。大筒木辉夜本来不是这片土地上的人，而是为了取得神树果实才来到这里的。辉夜下嫁给祖之国天子，成为侧妃。遭遇背叛，侍女爱野死亡。
大筒木辉夜吃了神树果实之后利用查克拉开始平定战争
大筒木羽衣诞生。忍宗的始祖，后来被称为六道仙人。六道仙人是三大瞳术之一的血继限界?轮回眼的最初的开眼者，是尾兽?十尾最初的人柱力。
大筒木羽村诞生。羽衣的弟弟，辉夜的儿子，拥有白眼，也能使用六道之力。后迁居到月球，子孙后代分出两派自相残杀灭亡。
“辉夜”的孩子生下就拥有查克拉，但是神树因为查克拉被夺走而愤怒，为了夺回查克拉而暴走，这就是十尾。
羽衣的爱人羽织被当做神树供奉死亡，羽衣开启写轮眼。
大筒木羽村和大筒木羽衣与辉夜和十尾战斗，羽衣开启轮回眼。六道仙人成为了人柱力，并将辉夜和十尾本体封印在月亮之中。黑绝诞生。
六道仙人的神剑“沼之矛”。能将对夙愿的强烈憧憬寄宿于剑上，因此又叫心愿之剑。过去六道仙人即是凭借此剑创造世界。
大筒木羽衣的忍宗。忍宗和忍术不同，忍宗是希望后人能够团结，彼此“相连”。
大弟子双海，二弟子三雄。
六道仙人的长子大筒木因陀罗诞生。一出生就拥有强大瞳力和悟性，被称为天才。知道自己的力量和其他人不同，什么事都以自己的力量解决。后代是宇智波一族，继承了六道仙人之眼，从小十分优秀，什么事情都能一个人完美解决，因此认为实现和平需要用“力量”。
六道仙人的次子大筒木阿修罗诞生。小的时候什么事情都做不好，一个人的话什么都不行。为了得到和哥哥因陀罗一样的力量，他不得不依靠自己的努力和他人的协助来增强实力。阿修罗是千手一族的始祖，与生俱来便继承了仙人的和生命力，掌管身体能量，认为和平需要爱。
阿修罗的伙伴：太藏、加斯卡、枝氏。妻子柑奈。
六道仙人指定弟弟阿修罗为继承人。相信“合作”才能获得真正的力量……六道仙人觉得弟弟阿修罗的想法是正确的，指名弟弟继承忍宗。这也成为后来千手一族和宇智波一族世代相争的原因。
六道仙人临终前将十尾分成九只尾兽。六道仙人用阴阳遁将十尾分成了九只尾兽，十尾的空壳变成了外道魔像，被封印在月亮内。
战国时代
战国时期，各个忍者族群仅仅受雇于人，没有固定的组织、国家。当时的忍者为了存活，甚至连姓氏都不能随便透露。忍者和平民的平均寿命只有30岁左右，导致平均寿命大幅度下降的原因即是：连幼小的孩童也要上战场拼命！