按照明朝宝船厂的工匠们给出的意见，所谓的马船，实际上就是将马厩搬上大船，在比较空船大船甲板上修建很多并排的马厩，以方便安置牛马。同时，又隔开牛马，防止它们之间相互争斗。
在船上建马厩的要领就是——方便清扫粪便……
所以，船上的马厩，往往都是修在船边沿。负责清扫的人，甚至不用进入马厩，直接用长柄的扫帚和铁锹，将牛粪和马粪铲起，然后扔进大海即可。然后，如果天气不冷的话，还可以用海水冲洗下马厩里的地板，以清除异味和苍蝇滋生的可能。
学到了这个经验后，纽约长岛造船厂的工匠们，就在船上顶层甲板四周一圈内侧修建了大量的马厩，将空间利用到了极致。
不过，在修完后，他们发现——中间的空间浪费了……
为了提高运输量，造船厂使用的是500吨级的大船，是由北海国战舰为模板改装成的。
其尺寸和北海国战舰差不多，都是40米长10米宽的经典4比1盖伦船造型。而且，是双层火炮甲板那种。当然，没放火炮。
10米的甲板宽度，而单列式马厩长度一般也就2米多长，一般在2.2米以内。如果只在甲板两侧修建靠边的马厩，那么，中间五米多的地方就空下来浪费了。
经过造船匠们的集体商议，最终他们在中间位置又增加了一排单列式马厩，用于安置牛马。至于牛粪和马粪的清理，则安排一天清理两次。至于中间位置的马厩甲板的清洗，造船工匠们经过反复讨论，最终确定了修一个甲板上的排水沟的计划。
他们将中间一排马厩的甲板垫高，然后在两侧修了专门的排水沟。这样，冲洗甲板时，水就顺着排水沟流走，并通过专门的地点流入大海。这样，就避免了甲板中间这一排马厩在冲洗甲板时容易导致积水的问题了。
这样一来，40米长的甲板，按照1.5米的单列式马厩的宽度，一排可以修26或27个马厩，三排就是80个。
而牛马船的模板是拥有双层火炮甲板的500吨级战舰，因此，两层火炮甲板都改造成三排马厩后，总共能装载160匹马，或者160头牛。
至于船上的船员，则住在底舱，或者船上的艉楼里。因为运输牲口的牛马船不追求速度，所以船上修了艉楼，作为船长和高级船员的住处。毕竟，底舱比较闷气，一般是给低级水手住的。而船上的食物和牛马的饲料，一般也放在底舱。
不过，为了担心牛马得坏血病，在航行途中，牛马除了吃干草料外，牛马船还会在固定的地点停靠，在岸上收集一些青草和树叶，喂给牛马，以给他们补充维生素C。
不过，从波斯到欧洲本土，主要经过葡萄牙人的势力范围，只有莫桑比克沿海是和马林交好的西班牙人的势力范围。所以，在停靠点选择的问题上，马林还需要和葡萄牙人扯皮一番。
但是，现在绝对不是和葡萄牙人商议登陆补充青草地点的好时机。因为，马林目前和葡萄牙人几乎闹翻了……
……
被“杰克船长”打劫后，那艘倒霉的葡萄牙香料运输船狼狈地返回了里斯本，并在葡萄牙掀起了轩然大波。
“杰克船长”的话，几乎明里表明了他的来历——受到马林的指使……